Відділи ОблСЕС Відділення гігієни дітей та підлітків: контроль за проведенням держсаннагляду гігієни дітей та підлітків за дошкільними, загальноосвітніми, вищими навчальними закладами, закладами професійно-технічної освіти, інтернатами , оздоровчими, позашкільними та іншими закладами для дітей. Відділення гігієни харчування: контроль за проведенням держсаннагляду гігієни харчування, за об'єктами харчової промисловості, торгівлі та громадського харчування. Відділення комунальної гігієни: контроль за проведенням держсаннагляду комунальної гігієни за об'єктами що є джерелами забруднення навколишнього середовища, водоймищ, грунту, очисних споруд, за лікувально-профілактичними та оздоровчими закладами, об'єктами водопостачання. Епідеміологічний відділ: контроль за організацією роботи лікувально-профілактичних закладів та закладів з профілактики інфекційних захворювань, організація та проведення імунопрофілактики. Відділ радіаційної гігієни: контроль за станом придбання, обліку, зберігання, використання та транспортування джерел іонізуючого випромінювання, вмістом радіонуклідів в харчових продуктах, будівельних матеріалах, воді та інших об'єктах довкілля. Відділення гігієни праці: контроль за проведенням держсаннагляду за об'єктами промисловості і сільського господарства з питань гігієни праці. Відділення по контролю за станом атмосферного повітря та ЕМВ: контроль за проведенням держсаннагляду за промисловими підприємствами, що є джерелами шуму, вібрації, електромагнітних випромінювань, та радіотехнічними об'єктами. Відділ особливо небезпечних інфекцій: контроль за організацією роботи лікувально-профілактичних закладів та інших закладів з профілактики особливо небезпечних інфекцій та організацію заходів з санітарної охорони території від завезення та розповсюдження карантинних інфекцій. Відділ санітарно-гігієнічної експертизи: контроль за проведенням санітарно-гігієнічної експертизи імпортної та вітчизняної продовольчої сировини, харчових продуктів та іншої продукції, що надходить на територію та виробляється у Харківській області. Відділ медичної паразитології: здійснює контроль та проводить епідеміологічне обстеження вогнищ гельмінтозів, захворювань, що викликаються кишковими найпростішими, іншими паразитами, в тому числі усіх випадків малярії, кліщового енцефаліту. Токсикологічна лабораторія: здійснює організацію держсанепіднагляду і лабораторного контролю за виконанням санітарного законодавства України з питань зберігання, транспортування , використання у народному господарстві пестицидів та агрохімікатів, за застосуванням полімерів, пластмас та виробів з них, інших непродовольчих товарів народного споживання.